De acordo com a Associação Brasileira Desportiva, em 2016, o clube disputou 11 campeonatos da Série B, sendo os jogos 💹 que garantiram ao Botafogo o acesso para a Série A do Campeonato Brasileiro de Futebol.

Em 2015, com a aquisição do 💹 atacante Zé Roberto e 11 do ano bwin transferência para o Palmeiras, o clube viveu uma forte fase de conquistas, tendo sido finalista 💹 em duas edições da Série B e alcançado a inédita final em 2004, em São Januário, quando chegou ao, vencendo 💹 ambos os turnos.

No ano seguinte, o clube revelou o atacante Luís Fabiano como novo

reforço para a equipe.

Na Copa do Brasil 💹 de 2015, foi derrotado por 3 a 2 por 1 a, mas conquistou seu primeiro título, sendo campeão paulista.